بررسی چندشکلی ژن های gdf۹ و bmp۱۵ در گوسفند مهربان برای یافتن جهش های تأثیرگذار روی پروتیئن
نویسندگان
چکیده
بهرهگیری از ژنهای عمده باروری از قبیل gdf9 و bmp15 به بهبود صفات تولیدمثلی در برنامههای اصلاح نژادی گوسفند کمک شایانی خواهد نمود. به منظور ارزیابی جهشهای نقطهای بر روی عملکرد پروتئین، چندشکلی ژنهای gdf9 و bmp15 بر روی 12 گوسفند مهربان به وسیله توالی یابی dna و مدلسازی ساختار پروتئین بررسی شد. تعداد شش چندشکلی تک نوکلئوتیدی شناخته شده به عنوان جهشهای fecg (g1-g6) در اگزون شماره 1 و 2 ژن gdf9 یافت شد. از میان چندشکلیهای یافت شده، جهش g1 (gdf9 exon1 g.2118 g>a)، g1 (gdf9 exon1 g.2118 g>a) و g6 (gdf9 exon 2 g.3974 g>a) ، جایگزینی اسیدآمینه را در ساختار پروتئین نشان دادهاند. هیچ چندشکلی در اگزون 1 و 2 ژن bmp15 یافت نشد. بر اساس چندشکلیهای شناسایی شده، افراد به سه دسته هاپلوتایپی از قبیل هاپلوتایپ وحشی (بدون جهش)، هاپلوتایپ a (جهشهای همزمان g1، g2، g3 و g4) و هاپلوتایپ b (جهشهای همزمان g5 و g6) تقسیمبندی شدند. ساختار سه بُعدی پروتئین gdf9 در هاپلوتایپ a و b به ترتیب یک چرخش 90 و 45 درجهای را نسبت به هاپلوتایپ نوع وحشی نشان داد. واریانتهای g1/p.arg87his، g4/p.glu241lysو g6/p.val332ile بر روی پروتئین بیتأثیر بودند. در حالیکه دو جهشg7/p.val371met وg8/p.ser315phe به احتمال زیاد تأثیرات مخرب بر روی پروتئین داشتند. بر اساس آنالیز درخت تکامل ژن gdf9، افراد هاپلوتایپ a و b به ترتیب به ارزش خود راه اندازی 63 و 76 از هاپلوتایپ نوع وحشی فاصله داشتند. در نتیجه، پروتین gdf9 در افراد هاپلوتایپ نوع a و b به دلیل اثرات سینرژیسم جهشهای همزمان عملکرد بالاتری را نسبت به افراد هاپلوتایپ نوع وحشی نشان میدهد. این نوع جهشها با تأثیر بر روی مارپیچ و چرخشهای پروتئین gdf9 در نواحی حفاظتی، منجر به اندرکنش فیزیکی پروتئین gdf9 با پروتئینهای فاکتور تبدیل کننده رشد بتا (tgfβ) میشوند.
منابع مشابه
چندشکلی واریانت های g۱ و b۴ ژن های gdf۹ و bmp۱۵ در گوسفند دالاق
در سالهای اخیر جهشهایی با اثرات عمده روی نرخ تخمکریزی در دو جایگاه ژنی مربوط به لیگاندهای tgfβ و نیز گیرندههای مربوط به tgfβ شناسایی شده است. این مطالعه برای شناسایی چندشکلیهای مربوط به لیگاندهای bmp15 (واریانت b4) و gdf9 (واریانتg1) در گوسفند دالاق انجام شد. 100 نمونه خون از دو گله در سطح شهرستان گنبد کاووس جمعآوری شد و استخراج dna به روش بهینه یافته نمکی انجام گرفت. با استفاده از دو ...
متن کاملارتباط چندشکلی ژن های gdf۹ و bmp۱۵ با صفت چند قلوزایی در بز مرخز
چند قلوزایی یکی از مهمترین صفات اقتصادی در پرورش بز است، که علاوه بر تأثیر پذیری از ژن های کوچک اثر، تحت تأثیر ژن های با اثر بزرگ نیز می باشد. در دهه های اخیر مشخص شد که دو عضو متعلق به خانواده فاکتورهای رشد با منشأ اووسیتی به نامهایgdf9 وbmp15 برای رشد فولیکولی و تخمک ریزی ضروری هستند. هدف از پژوهش حاضر مطلعهی چند شکلی در جایگاههای ژنی gdf9 وbmp15 و ارتباط الگوهای ژنوتیپی شناسایی شده در...
متن کاملبررسی چندشکلی ژن بتالاکتوگلوبولین گوسفند به روش PCR-RFLP
In modern programmes of animal breeding, the polymorphisms of the milk proteins can be used as marker systems. Beta-Lactoglobulin is the major milk whey protein in the ruminants. The BLG coding gene located on ovine chromosome 3. This protein, synthesis in the mammary glands during pregnancy and the lactation stages. Studies have indicated that this protein is polymorphic in the many breeds of ...
متن کاملبررسی چندشکلی ژن بتالاکتوگلوبولین گوسفند به روش PCR-RFLP
In modern programmes of animal breeding, the polymorphisms of the milk proteins can be used as marker systems. Beta-Lactoglobulin is the major milk whey protein in the ruminants. The BLG coding gene located on ovine chromosome 3. This protein, synthesis in the mammary glands during pregnancy and the lactation stages. Studies have indicated that this protein is polymorphic in the many breeds of ...
متن کاملبررسی چندشکلی ژن میوستاتین در سه نژاد گوسفند ایرانی شال، زل و زندی
میوستاتین (MSTN) که عامل رشد و تمایز شماره 8 (GDF8) نیز نامیده می شود از گروه عوامل تغییر رشد بتا (TGF?) می باشد که در کاهش رشد در پستانداران نقش دارد. یک چند شکلی تـک نوکلئوتیدی (SNP) در ناحیه ترجمه نشده َ3 (3'UTR) ژن میوستاتین به عنوان عامل هایپرتروفی عضله در کروموزوم شماره 2 (OAR2) نژادهای گوسفند اروپایی تشخیص داده شده است. در این تحقیق، برای شناسایی چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNP) ژن میوستاتین د...
متن کاملبررسی جهش های نادر ژن بتاگلوبین در شمال غرب کشور
Introduction: Recent molecular studies on Iranian β-thalassemia genes revealed the presence of eight common mutations associated with thalassemia. Although these mutations are frequent, there are other rare and unknown mutations that can create large problems in designing preventive programs. We detected and explained the common mutations in north-western Iran previously and detection of the ra...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
iranian journal of applied animal scienceجلد ۶، شماره ۴، صفحات ۸۶۳-۸۷۲
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023