بررسی چندشکلی ژن های gdf۹ و bmp۱۵ در گوسفند مهربان برای یافتن جهش های تأثیرگذار روی پروتیئن

نویسندگان

a. ahmadi

department of animal science, faculty of agriculture, bu ali sina university, hamedan, iran f. afraz

department of genomics and animal, agricultural biotechnology research institute (abri), north branch, rasht, iran r. talebi

department of animal science, faculty of agriculture, bu ali sina university, hamedan, iran a. farahavar

department of animal science, faculty of agriculture, bu ali sina university, hamedan, iran s.m.f. vahidi

چکیده

بهره­گیری از ژن­های عمده­ باروری از قبیل gdf9 و bmp15 به بهبود صفات تولیدمثلی در برنامه­های اصلاح نژادی گوسفند کمک شایانی خواهد نمود. به منظور ارزیابی جهش­های نقطه­ای بر روی عملکرد پروتئین، چندشکلی ژن­های gdf9 و bmp15 بر روی 12 گوسفند مهربان به وسیله توالی یابی dna و مدل­سازی ساختار پروتئین بررسی شد. تعداد شش چندشکلی تک نوکلئوتیدی شناخته شده به عنوان جهش­های fecg (g1-g6) در اگزون شماره 1 و 2 ژن gdf9 یافت شد. از میان چندشکلی­های یافت شده، جهش g1 (gdf9 exon1 g.2118 g>a)، g1 (gdf9 exon1 g.2118 g>a) و g6 (gdf9 exon 2 g.3974 g>a) ، جایگزینی اسید­آمینه را در ساختار پروتئین نشان داده­اند. هیچ چندشکلی در اگزون 1 و 2 ژن bmp15 یافت نشد. بر اساس چندشکلی­های شناسایی شده، افراد به سه دسته هاپلوتایپی از قبیل هاپلوتایپ وحشی (بدون جهش)، هاپلوتایپ a (جهش­های همزمان g1، g2، g3 و g4) و هاپلوتایپ b (جهش­های همزمان g5 و g6) تقسیم­بندی شدند. ساختار سه بُعدی پروتئین gdf9 در هاپلوتایپ a و b به ترتیب یک چرخش 90 و 45 درجه­ای را نسبت به هاپلوتایپ نوع وحشی نشان داد. واریانتهای g1/p.arg87his، g4/p.glu241lysو g6/p.val332ile بر روی پروتئین بی­تأثیر بودند. در حالیکه دو جهشg7/p.val371met  وg8/p.ser315phe به احتمال زیاد تأثیرات مخرب بر روی پروتئین داشتند. بر اساس آنالیز درخت تکامل ژن gdf9، افراد هاپلوتایپ a و b به ترتیب به ارزش خود راه اندازی 63 و 76 از هاپلوتایپ نوع وحشی فاصله داشتند. در نتیجه، پروتین gdf9 در افراد هاپلوتایپ نوع a و b به دلیل اثرات سینرژیسم جهش­های همزمان عملکرد بالاتری را نسبت به افراد هاپلوتایپ نوع وحشی نشان می­دهد. این نوع جهش­ها با تأثیر بر روی مارپیچ و چرخش­های پروتئین gdf9 در نواحی حفاظتی، منجر به اندرکنش فیزیکی پروتئین gdf9 با پروتئین­های فاکتور تبدیل کننده رشد بتا (tgfβ) می­شوند.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

چندشکلی واریانت های g۱ و b۴ ژن های gdf۹ و bmp۱۵ در گوسفند دالاق

در سال­های اخیر جهش­هایی با اثرات عمده روی نرخ تخمک­ریزی در دو جایگاه ژنی مربوط به لیگاند­های tgfβ و نیز گیرنده­های مربوط به tgfβ شناسایی شده ­است. این مطالعه برای شناسایی چند­شکلی­های مربوط به لیگاندهای bmp15 (واریانت b4) و gdf9 (واریانتg1) در گوسفند دالاق انجام شد. 100 نمونه خون از دو گله در سطح شهرستان گنبد کاووس جمع­آوری شد و استخراج dna به روش بهینه یافته نمکی انجام گرفت. با استفاده از دو ...

متن کامل

ارتباط چندشکلی ژن های gdf۹ و bmp۱۵ با صفت چند قلوزایی در بز مرخز

چند قلوزایی یکی از مهم­ترین صفات اقتصادی در پرورش بز است، که علاوه بر تأثیر پذیری از ژن های کوچک اثر، تحت تأثیر ژن های با اثر بزرگ نیز می باشد. در دهه های اخیر مشخص شد که دو عضو متعلق به خانواده فاکتورهای رشد با منشأ اووسیتی به نام­هایgdf9  وbmp15  برای رشد فولیکولی و تخمک ریزی ضروری هستند. هدف از پژوهش حاضر مطلعه­ی چند شکلی در جایگاه­های ژنی gdf9 وbmp15  و ارتباط الگوهای ژنوتیپی شناسایی شده در...

متن کامل

بررسی چندشکلی ژن بتالاکتوگلوبولین گوسفند به روش PCR-RFLP

In modern programmes of animal breeding, the polymorphisms of the milk proteins can be used as marker systems. Beta-Lactoglobulin is the major milk whey protein in the ruminants. The BLG coding gene located on ovine chromosome 3. This protein, synthesis in the mammary glands during pregnancy and the lactation stages. Studies have indicated that this protein is polymorphic in the many breeds of ...

متن کامل

بررسی چندشکلی ژن بتالاکتوگلوبولین گوسفند به روش PCR-RFLP

In modern programmes of animal breeding, the polymorphisms of the milk proteins can be used as marker systems. Beta-Lactoglobulin is the major milk whey protein in the ruminants. The BLG coding gene located on ovine chromosome 3. This protein, synthesis in the mammary glands during pregnancy and the lactation stages. Studies have indicated that this protein is polymorphic in the many breeds of ...

متن کامل

بررسی چندشکلی ژن میوستاتین در سه نژاد گوسفند ایرانی شال، زل و زندی

میوستاتین (MSTN) که عامل رشد و تمایز شماره 8 (GDF8) نیز نامیده می شود از گروه عوامل تغییر رشد بتا (TGF?) می باشد که در کاهش رشد در پستانداران نقش دارد. یک چند شکلی تـک نوکلئوتیدی (SNP) در ناحیه ترجمه نشده َ3 (3'UTR) ژن میوستاتین به عنوان عامل هایپرتروفی عضله در کروموزوم شماره 2 (OAR2) نژادهای گوسفند اروپایی تشخیص داده شده است. در این تحقیق، برای شناسایی چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNP) ژن میوستاتین د...

متن کامل

بررسی جهش های نادر ژن بتاگلوبین در شمال غرب کشور

Introduction: Recent molecular studies on Iranian β-thalassemia genes revealed the presence of eight common mutations associated with thalassemia. Although these mutations are frequent, there are other rare and unknown mutations that can create large problems in designing preventive programs. We detected and explained the common mutations in north-western Iran previously and detection of the ra...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
iranian journal of applied animal science

جلد ۶، شماره ۴، صفحات ۸۶۳-۸۷۲

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023